Encore mieux: formate le en EXT3.
Il s'agit du filesystem natif de Linux: propre et non-fragmentable.
Pour windows, il suffit d'installer le driver qui va bien et c'est fini!
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http://ext2fsd.sourceforge.net/ (driver pour xp/vista) - je n'ai pas testé, mais c'est le plus récent du point de vue des MAJ
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http://www.fs-driver.org/ (driver pour XP/2003) - testé & marche très bien, par contre aucune idée de la compatibilité Vista
P.S: je déconseille NTFS sur des disques externes USB, outre ses problèmes structurels intrinsèques, les performances sont très très mauvaises comparées aux autres filesystems (ça doit probablement être du à une mauvaise interaction entre la taille des blocs NTFS et la taille des requêtes USB par défaut, ce qui crée de la fragmentation des données au transport et donc une baisse de débit).